《實(shí)施意見》包含4項主要原則。 一是創(chuàng)新引領(lǐng)發(fā)展。圍繞生態(tài)環(huán)境保護(hù)事業(yè)長遠(yuǎn)發(fā)展需要，頂層謀劃未來一段時間的科技創(chuàng)新工作思路和重點(diǎn)任務(wù)，凸顯科技的引領(lǐng)作用。二是優(yōu)先支撐管理。以打好污染防治攻堅戰(zhàn)和生態(tài)環(huán)境保護(hù)為基本點(diǎn)出發(fā)，圍繞當(dāng)前打好污染防治攻堅戰(zhàn)需求，深化科技體制改革，引導(dǎo)科研人員積極投身污染防治攻堅戰(zhàn)，并激勵科研人員發(fā)揮主觀能動性和創(chuàng)造力，在生態(tài)環(huán)境保護(hù)中取得重大突破，發(fā)揮科技支撐與引領(lǐng)作用。三是協(xié)同整體推進(jìn)。結(jié)合實(shí)際情況，圍繞促進(jìn)科技創(chuàng)新活動的人才、平臺、項目、經(jīng)費(fèi)、體制、機(jī)制、文化等全要素，全面深化科技體制改革，全面落實(shí)中央和國家最新的文件政策要求，優(yōu)化管理流程，提高績效。四是突出重點(diǎn)任務(wù)。圍繞科研單位“人、財、物”等關(guān)鍵改革，以及弘揚(yáng)科學(xué)家精神等方面為重點(diǎn)，提出了針對性的意見和具體的舉措。

《實(shí)施意見》共18條內(nèi)容，涵蓋了能力體系建設(shè)、科研項目管理、“放管服”改革、高層次人才隊伍建設(shè)、科技成果轉(zhuǎn)化、作風(fēng)學(xué)風(fēng)建設(shè)六大方面。總體來說，圍繞“激發(fā)科技創(chuàng)新活力”這條主線，重點(diǎn)在能力建設(shè)、項目管理、放管服改革、人才隊伍、成果轉(zhuǎn)化和創(chuàng)新環(huán)境6個領(lǐng)域進(jìn)行突破。在優(yōu)化科研立項，加大投入力度方面，《實(shí)施意見》指出，推進(jìn)政府購買服務(wù)改革，對適宜由部屬科研單位或其他社會力量承擔(dān)的政府購買服務(wù)事項，采用直接委托或競爭性購買等方式，實(shí)行合同化管理。部屬科研單位承接政府購買服務(wù)取得的收入，應(yīng)當(dāng)納入單位預(yù)算統(tǒng)一核算，依法納稅并享受相關(guān)稅收優(yōu)惠等政策，稅后收入由受托單位按相關(guān)政策規(guī)定進(jìn)行支配。